数据挖掘—miRNA调节网络的构建

由于人类的基因数量巨大,miRNA作为调控这些基因表达的非编码RNA,其与基因的关系非常复杂。当前基因样本数目高达两万多维,随着维数的增加,获取基因与miRNA之间的关系的难度也随之增加。近年来关于基因和miRNA之间关系的研究成为生物信息学的一个热点。研究者们发现众多疾病间存在很多共性,比如某些基因和miRNA在多种疾病中都有相似的表达,需要通过一定方法识别这些疾病中相关的miRNA和基因的调控关系。目前建立两者的调控关系方法有很多,包括数据库比对,算法的运用,实验的验证等等。这些都会通过详细的介绍传递给大家。并会通过具体的操作向大家演示如何构建两者的关系。相较于之前推出的《豪斯医生基因数据挖掘》和《WGCNA详解》,此次课程在内容上进行了延伸,将重点回到了非编码RNA的调控网络上。这过程中,不仅会重新温故之前的知识,又将WGCNA作为一种新的算法构建miRNA与mRNA的关系。

具体地,你将进一步了解非编码RNA数据的下载和处理,WGCNA的理论和操作,数据库的比对,cytoscape的灵活玩转,还有R语言的基本语法。该课程的学习会为大家在科研的道路中增加新的助力。

课程目录

├──01、TCGA概述

| ├──01、TCGA概述.mp4 68.48M

| ├──02、TCGA概述.mp4 17.61M

| └──03、TCGA概述.mp4 37.08M

├──02、构建调控关系理论

| ├──01、构建调控关系理论.mp4 18.94M

| ├──02、构建调控关系理论.mp4 66.52M

| └──03、构建调控关系理论.mp4 141.73M

├──03、WGCNA理论

| ├──01、WGCNA理论.mp4 24.27M

| ├──02、WGCNA理论.mp4 18.90M

| ├──03、WGCNA理论.mp4 20.97M

| └──04、WGCNA理论.mp4 53.19M

├──04、数据下载

| ├──01、数据下载.mp4 55.22M

| ├──02、数据下载.mp4 52.12M

| ├──03、数据下载.mp4 47.11M

| └──04、数据下载.mp4 96.09M

├──05、提取蛋白编码基因

| ├──01、提取蛋白编码基因.mp4 64.98M

| ├──02、提取蛋白编码基因.mp4 51.92M

| ├──03、提取蛋白编码基因.mp4 56.89M

| ├──04、提取蛋白编码基因.mp4 56.79M

| └──05、提取蛋白编码基因.mp4 105.10M

├──06、差异分析

| ├──01、差异分析.mp4 52.20M

| ├──02、差异分析.mp4 41.62M

| └──03、差异分析.mp4 98.34M

├──07、基于算法构建调控

| ├──01、基于算法构建调控.mp4 64.70M

| ├──02、基于算法构建调控.mp4 58.44M

| ├──03、基于算法构建调控.mp4 54.62M

| └──04、基于算法构建调控.mp4 64.92M

├──08、cytoscape构建网络

| ├──01、cytoscape构建网络.mp4 60.00M

| └──02、cytoscape构建网络.mp4 105.75M

└──09、数据库预测

| ├──01、数据库预测.mp4 47.45M

| ├──02、数据库预测.mp4 272.25M

| ├──03、数据库预测.mp4 44.58M

| └──04、数据库预测.mp4 96.81M